LAMMPS data file. CGCMM Style. atom_style full. Created by charmm2lammps v1.9.1 on Thu Feb 22 15:58:42 IST 2018 22 atoms 21 bonds 36 angles 43 dihedrals 4 impropers 8 atom types 10 bond types 20 angle types 28 dihedral types 4 improper types 4.03 9.752 xlo xhi -1.982 3.447 ylo yhi 9.698 15.912 zlo zhi Masses 1 0 # 2 1.008 # H 3 1.008 # HA 4 12.011 # C 5 12.011 # CT1 6 12.011 # CT3 7 14.007 # NH1 8 15.999 # O Pair Coeffs # lj/charmm/coul/long 2 0.046 0.400013524445 0.046 0.400013524445 # H 3 0.022 2.35197261589 0.022 2.35197261589 # HA 4 0.11 3.56359487256 0.11 3.56359487256 # C 5 0.032 3.56359487256 0.01 3.38541512893 # CT1 6 0.078 3.63486677001 0.01 3.38541512893 # CT3 7 0.2 3.29632525712 0.2 2.76178602624 # NH1 8 0.12 3.02905564168 0.12 2.49451641079 # O Atoms # full 1 1 6 -0.27 4.684 -0.562 14.838 # CT3 2 1 3 0.09 4.03 -1.401 14.524 # HA 3 1 3 0.09 4.14 0.399 14.716 # HA 4 1 3 0.09 4.944 -0.692 15.912 # HA 5 1 4 0.51 5.926 -0.549 14.036 # C 6 1 8 -0.51 7.027 -0.604 14.566 # O 7 1 7 -0.47 5.782 -0.465 12.709 # NH1 8 1 2 0.31 4.878 -0.403 12.305 # H 9 1 5 0.07 6.901 -0.466 11.787 # CT1 10 1 1 0.09 7.656 -1.148 12.157 # 11 1 6 -0.27 6.425 -0.97 10.409 # CT3 12 1 3 0.09 5.663 -0.283 9.982 # HA 13 1 3 0.09 7.278 -1.026 9.698 # HA 14 1 3 0.09 5.98 -1.982 10.503 # HA 15 1 4 0.51 7.567 0.906 11.659 # C 16 1 8 -0.51 7.476 1.579 10.635 # O 17 1 7 -0.47 8.265 1.344 12.722 # NH1 18 1 2 0.31 8.262 0.787 13.554 # H 19 1 6 -0.11 8.963 2.609 12.724 # CT3 20 1 3 0.09 8.258 3.447 12.521 # HA 21 1 3 0.09 9.752 2.622 11.937 # HA 22 1 3 0.09 9.446 2.787 13.709 # HA Bond Coeffs # harmonic 2 250 1.49 # C CT1 3 250 1.49 # C CT3 4 370 1.345 # C NH1 5 620 1.23 # C O 6 222.5 1.538 # CT1 CT3 7 320 1.43 # CT1 NH1 9 320 1.43 # CT3 NH1 10 440 0.997 # H NH1 Bonds 1 7 1 2 # CT3 HA 2 7 1 3 # CT3 HA 3 7 1 4 # CT3 HA 4 3 5 1 # C CT3 5 4 5 7 # C NH1 6 5 6 5 # C O 7 10 7 8 # H NH1 8 7 7 9 # CT1 NH1 9 0 9 10 # CT1 10 6 11 9 # CT1 CT3 11 7 11 12 # CT3 HA 12 7 11 13 # CT3 HA 13 7 11 14 # CT3 HA 14 4 15 17 # C NH1 15 2 15 9 # C CT1 16 5 16 15 # C O 17 10 17 18 # H NH1 18 9 17 19 # CT3 NH1 19 7 19 20 # CT3 HA 20 7 19 21 # CT3 HA 21 7 19 22 # CT3 HA Angle Coeffs # charmm 4 52 108 0 0 # C CT1 CT3 5 50 107 0 0 # C CT1 NH1 7 50 120 0 0 # C NH1 CT1 8 50 120 0 0 # C NH1 CT3 9 34 123 0 0 # C NH1 H 10 80 116.5 0 0 # CT1 C NH1 11 80 121 0 0 # CT1 C O 13 35 117 0 0 # CT1 NH1 H 14 80 116.5 0 0 # CT3 C NH1 15 80 121 0 0 # CT3 C O 16 70 113.5 0 0 # CT3 CT1 NH1 17 35 117 0 0 # CT3 NH1 H 20 80 122.5 0 0 # NH1 C O Angles 1 15 1 5 6 # CT3 C O 2 14 1 5 7 # CT3 C NH1 3 17 2 1 4 # HA CT3 HA 4 17 2 1 3 # HA CT3 HA 5 17 3 1 4 # HA CT3 HA 6 7 5 7 9 # C NH1 CT1 7 9 5 7 8 # C NH1 H 8 5 5 1 4 # C CT3 HA 9 5 5 1 3 # C CT3 HA 10 5 5 1 2 # C CT3 HA 11 2 7 9 10 # CT1 NH1 12 5 7 9 15 # C CT1 NH1 13 20 7 5 6 # NH1 C O 14 13 8 7 9 # CT1 NH1 H 15 11 9 15 16 # CT1 C O 16 11 9 11 14 # CT1 CT3 HA 17 11 9 11 13 # CT1 CT3 HA 18 11 9 11 12 # CT1 CT3 HA 19 1 11 9 10 # CT1 CT3 20 4 11 9 15 # C CT1 CT3 21 16 11 9 7 # CT3 CT1 NH1 22 17 12 11 14 # HA CT3 HA 23 17 12 11 13 # HA CT3 HA 24 17 13 11 14 # HA CT3 HA 25 8 15 17 19 # C NH1 CT3 26 9 15 17 18 # C NH1 H 27 0 15 9 10 # CT1 C 28 18 17 19 22 # HA CT3 NH1 29 18 17 19 21 # HA CT3 NH1 30 18 17 19 20 # HA CT3 NH1 31 20 17 15 16 # NH1 C O 32 10 17 15 9 # CT1 C NH1 33 17 18 17 19 # CT3 NH1 H 34 17 20 19 22 # HA CT3 HA 35 17 20 19 21 # HA CT3 HA 36 17 21 19 22 # HA CT3 HA Dihedral Coeffs # charmm 6 0.2 3 0 1 # C CT1 CT3 HA 7 0.2 1 180 1 # C CT1 NH1 C 8 0 1 0 1 # C CT1 NH1 H 9 1.8 1 0 1 # C NH1 CT1 CT3 11 1.6 1 0 1 # CT1 C NH1 CT3 12 2.5 2 180 0 # CT1 C NH1 CT3 13 2.5 2 180 1 # CT1 C NH1 H 14 1.6 1 0 1 # CT1 NH1 C CT3 15 2.5 2 180 0 # CT1 NH1 C CT3 16 2.5 2 180 1 # CT1 NH1 C O 17 2.5 2 180 1 # CT3 C NH1 H 18 0 1 0 1 # CT3 CT1 C NH1 19 1.4 1 0 1 # CT3 CT1 C O 20 0 1 0 1 # CT3 CT1 NH1 H 21 2.5 2 180 1 # CT3 NH1 C O 22 2.5 2 180 1 # H NH1 C O 26 0.2 3 0 1 # HA CT3 CT1 NH1 27 0.6 1 0 1 # NH1 C CT1 NH1 28 0 1 0 1 # NH1 CT1 C O Dihedrals 1 17 1 5 7 8 # CT3 C NH1 H 2 14 1 5 7 9 # CT1 NH1 C CT3 3 15 1 5 7 9 # CT1 NH1 C CT3 4 23 2 1 5 7 # HA CT3 C NH1 5 24 2 1 5 6 # HA CT3 C O 6 23 3 1 5 7 # HA CT3 C NH1 7 24 3 1 5 6 # HA CT3 C O 8 23 4 1 5 7 # HA CT3 C NH1 9 24 4 1 5 6 # HA CT3 C O 10 9 5 7 9 11 # C NH1 CT1 CT3 11 7 5 7 9 15 # C CT1 NH1 C 12 3 5 7 9 10 # CT1 NH1 C 13 22 6 5 7 8 # H NH1 C O 14 16 6 5 7 9 # CT1 NH1 C O 15 26 7 9 11 12 # HA CT3 CT1 NH1 16 26 7 9 11 13 # HA CT3 CT1 NH1 17 26 7 9 11 14 # HA CT3 CT1 NH1 18 27 7 9 15 17 # NH1 C CT1 NH1 19 28 7 9 15 16 # NH1 CT1 C O 20 20 8 7 9 11 # CT3 CT1 NH1 H 21 8 8 7 9 15 # C CT1 NH1 H 22 4 8 7 9 10 # CT1 NH1 H 23 13 9 15 17 18 # CT1 C NH1 H 24 11 9 15 17 19 # CT1 C NH1 CT3 25 12 9 15 17 19 # CT1 C NH1 CT3 26 2 10 9 11 12 # CT1 CT3 HA 27 2 10 9 11 13 # CT1 CT3 HA 28 2 10 9 11 14 # CT1 CT3 HA 29 0 10 9 15 17 # CT1 C NH1 30 1 10 9 15 16 # CT1 C O 31 18 11 9 15 17 # CT3 CT1 C NH1 32 19 11 9 15 16 # CT3 CT1 C O 33 6 12 11 9 15 # C CT1 CT3 HA 34 6 13 11 9 15 # C CT1 CT3 HA 35 6 14 11 9 15 # C CT1 CT3 HA 36 9 15 17 19 20 # C NH1 CT3 HA 37 9 15 17 19 21 # C NH1 CT3 HA 38 9 15 17 19 22 # C NH1 CT3 HA 39 22 16 15 17 18 # H NH1 C O 40 21 16 15 17 19 # CT3 NH1 C O 41 22 18 17 19 20 # H NH1 CT3 HA 42 22 18 17 19 21 # H NH1 CT3 HA 43 22 18 17 19 22 # H NH1 CT3 HA Improper Coeffs # harmonic 1 120 0 # C CT1 NH1 O 2 120 0 # C CT3 NH1 O 3 20 0 # H CT1 C NH1 4 20 0 # H CT3 C NH1 Impropers 1 2 5 1 7 6 # C CT3 NH1 O 2 3 7 5 9 8 # H CT1 C NH1 3 1 15 9 17 16 # C CT1 NH1 O 4 4 17 15 19 18 # H CT3 C NH1